国家重点研发计划

 “疾病研究精准医学知识库构建”项目2017年年终汇报会议成功在复旦大学召开

 “疾病研究精准医学知识库构建”项目17年年终工作总结汇报会议于12月28日在复旦大学枫林校区明道楼外宾会议室举办,本次会议由项目牵头单位复旦大学主办,会期一天,项目参与单位共13家共同汇报项目17年所取得工作进展以及探讨18年的工作计划,本次会议同时邀请了本领域专家组成专家委员会对项目工作进行点评。

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会议开始时,复旦大学生物医学研究院党委书记储以薇教授为本次会议进行致辞,项目首席刘雷教授宣读了本次会议的主要议题。

项目组五个子课题分别就所取得的工作进展进行了工作汇报,其中课题一由中国医学科学院医学信息研究所为代表汇报工作,共整合53部生物医学相关词表(术语4,567,208个,概念1,372,967个),新入词表三个,精准医学顶层本体升级至2.0版本;课题二采取任务分解方式进行汇报,其中完成5个目标信息源文本资源更新和入库,2000篇文献标注工作,形成具有一定规模的精准医学文本语料库,完善实体识别模型,初步实现实体关系网络可视化;课题三共完成三项任务指标,其中包括完成与课题一本体映射,已收集数据库的数据清洗和整合,开展并完善跨库融合算法,辅助完成数据库整合;课题四针对考核指标完成任务分为四块内容,其中包括三项工具集的开发,注释算法和软件的开发,人工申编平台和精准医学知识申编社区平台的开发,知识存储数据结构设计完成;课题五核心工作为完成精准医学知识库可视化系统,为此,共完成搜索界面设计数据搜索步骤数据可视化功能设计数据可视化界面设计通路信息展示设计;最后项目首席刘雷教授重新回述了项目各级任务指标,并核对考核指标分别对各个课题组的工作进行总结汇报。

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此次年终会议项目组邀请了上海交通大学吕晖研究员中国医学科学院信息研究所副所长钱庆研究员、中国军事医学科学院伯晓晨研究员等三位外校专家组成专家委员会对项目工作进行点评,三位专家均表示认真聆听了各课题组的工作汇报并给与赞扬,认为项目组目前工作进度符合任务书中的考核指标,在部分工作中甚至超标准完成,同时三位专家就工作中一些问题进行了提问给出相应的建议。